法律分析：工厂对有案底的员工档案一般是没有办法查出来的，因为目前我国公民的个人相关信息（包括是否有案底）还不能实现上网查询，因此，企业也就无法查询（企业请求公安机关协查除外）。尽管这样，有案底的人员，只要重新做人，改过自新，遵章守法，还是受欢迎的，同时，有案底的人，其就业权受法律保护。
法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》
第二百七十五条 犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。
犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
最高人民法院 最高人民检察院公安部 国家安全部 司法部《关于建立犯罪人员犯罪记录制度的意见》 犯罪记录是国家专门机关对犯罪人员情况的客观记载。犯罪记录制度是现代社会管理制度中的一项重要内容。为适应新时期经济社会发展的需要，进一步推进社会管理创新，维护社会稳定，促进社会和谐，现就建立我国犯罪人员犯罪记录制度提出如下意见。
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